Statistik över provsamlingen och genomiska data

BTBs provsamling innehåller framförallt färskfryst material men även formalinfixerat material, diagnostiska H&E-färgade tumörsnitt på mikroskopglas (eller scannad bild) samt imprintglas. I vissa fall finns även cerebrospinalvätska och isolerade viabla celler från biopsi av maligna CNS-tumörer. Blodprov från motsvarande patient (sk. parat blodprov) inhämtas också, samt blodprov från föräldrar. BTB planerar att utöka provinsamlingen gällande färsk vävnad för cellsuspensioner från ytterligare tumörtyper och centra, samt standardisera insamling av cerebrospinalvätska. Dessutom planeras för att påbörja insamling av blodplasma. Provsamlingen utökas med fler provtyper samt dataanalyser för att öka forskningsnyttan med biobanksresursen och möjliggöra flera relevanta studier och framsteg som gagnar barncancerpatienterna. 

Under år 2022-2023 så genomförde BTB en stor satsning på att helgenomsekvensera de solida tumörer samt parade blodprov i provsamlingen där det fanns tillräckligt kvalitativt material, men som ännu inte analyserats. Det inkluderade även heltranskriptom-sekvensering på fryst tumörvävnad och metylerings-array på CNS-tumörer och sarkom. I tabellen nedan visas vävnads- och provtyper i Barntumörbanken.